Наиболее важными объектами полевой инфраструктуры являются зимовья. Сегодня на территории Байкальского заповедника действует 35 таких построек, образующих сеть опорных пунктов охраны и проведения научных исследований.
В пределах основных маршрутов зимовья располагаются сравнительно недалеко друг от друга — ориентировочно в шести километрах, или в пределах полудневного перехода. Это имеет большое практическое значение. Ведь во время полевого выхода необходимо не только преодолеть определённое расстояние, но и выполнить запланированные работы: провести обследование, наблюдение, учёт или охранное мероприятие.
Когда на маршруте через каждые несколько часов имеется возможность остановиться в оборудованном зимовье, работу можно организовать значительно эффективнее. Это позволяет разумно распределять силы, выбирать продолжительность переходов и использовать оставшееся время непосредственно для выполнения поставленных задач.
Устройство большинства зимовий достаточно простое. Основу составляет деревянный сруб, надёжная крыша и отопительная печь. Внутри оборудуются нары для отдыха, стол для приготовления и приёма пищи, места хранения необходимых вещей.
Постепенно каждое зимовье обрастает собственным хозяйством. Здесь находятся посуда, различная утварь, топор, пила и другие инструменты, необходимые для жизни и обслуживания постройки. Обязательной частью хозяйства является запас сухих дров, обычно размещаемый в отдельном прирубе или специально отведённом месте. Иногда сохраняются небольшие запасы продуктов — то, что оставили предыдущие посетители, или своеобразный неразменный запас на случай необходимости.
Особое значение имеет печь. Для отопления используются металлические печи, масса которых, в зависимости от конструкции, может превышать 30 килограммов. Дымоходы устраиваются по возможности прямыми, без лишних изгибов. Даже в сильные зимние морозы исправная печь позволяет обогреть помещение, высушить одежду и обеспечить необходимые условия для отдыха.
При этом важнейшим условием долговечности зимовья остаётся сохранность деревянного сруба. Древесина должна оставаться сухой, а значит, состояние крыши приобретает первостепенное значение. Повреждённая кровля постепенно приводит к увлажнению и разрушению несущих конструкций, поэтому её своевременный ремонт — одна из основных задач обслуживания зимовий.